Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SAMD1Q6SPF0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SAMD1Q6SPF0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SAMD1Q6SPF0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms