Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC174Q6PII3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC174Q6PII3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC174Q6PII3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms