Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K8

GTF2H2C, General transcription factor IIH subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2CQ6P1K8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H2CQ6P1K8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H2CQ6P1K8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H2CQ6P1K8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H2CQ6P1K8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H2CQ6P1K8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H2CQ6P1K8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H2CQ6P1K8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H2CQ6P1K8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H2CQ6P1K8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H2CQ6P1K8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H2CQ6P1K8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H2CQ6P1K8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2H2CQ6P1K8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2H2CQ6P1K8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2H2CQ6P1K8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2H2CQ6P1K8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2H2CQ6P1K8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2H2CQ6P1K8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2H2CQ6P1K8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H2CQ6P1K8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H2CQ6P1K8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H2CQ6P1K8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H2CQ6P1K8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H2CQ6P1K8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2H2CQ6P1K8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H2CQ6P1K8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H2CQ6P1K8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H2CQ6P1K8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H2CQ6P1K8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H2CQ6P1K8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H2CQ6P1K8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2H2CQ6P1K8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms