Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRPF40BQ6NWY9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRPF40BQ6NWY9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF40BQ6NWY9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms