Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HMBOX1Q6NT76 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HMBOX1Q6NT76 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms