Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CAPN13Q6MZZ7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN13Q6MZZ7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CAPN13Q6MZZ7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms