Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDE2Q6IQ49 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SDE2Q6IQ49 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms