Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPH2Q6IBW4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NCAPH2Q6IBW4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NCAPH2Q6IBW4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NCAPH2Q6IBW4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms