Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTC19Q6DKK2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTC19Q6DKK2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms