Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LEMD1Q68G75 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LEMD1Q68G75 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LEMD1Q68G75 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LEMD1Q68G75 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LEMD1Q68G75 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LEMD1Q68G75 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms