Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCNX4Q63HM2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCNX4Q63HM2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCNX4Q63HM2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms