Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
USPL1Q5W0Q7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
USPL1Q5W0Q7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
USPL1Q5W0Q7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms