Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SUSD4Q5VX71 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUSD4Q5VX71 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SUSD4Q5VX71 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms