Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOGA3Q5TF21 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOGA3Q5TF21 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms