Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATAD3BQ5T9A4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATAD3BQ5T9A4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATAD3BQ5T9A4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms