Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SYT6Q5T7P8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SYT6Q5T7P8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms