Protein–RNA interactions for Protein: Q5T481

RBM20, RNA-binding protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM20Q5T481 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM20Q5T481 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM20Q5T481 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM20Q5T481 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM20Q5T481 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RBM20Q5T481 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBM20Q5T481 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM20Q5T481 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM20Q5T481 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms