Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC3LQ5T215 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
TRAPPC3LQ5T215 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms