Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC122Q5T0U0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC122Q5T0U0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms