Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NHSL1Q5SYE7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NHSL1Q5SYE7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
NHSL1Q5SYE7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NHSL1Q5SYE7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms