Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGT7

RTP2, Receptor-transporting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP2Q5QGT7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RTP2Q5QGT7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTP2Q5QGT7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RTP2Q5QGT7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms