Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SAMD4BQ5PRF9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAMD4BQ5PRF9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms