Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SPANXN4Q5MJ08 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SPANXN4Q5MJ08 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms