Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
AMER1Q5JTC6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
AMER1Q5JTC6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
AMER1Q5JTC6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms