Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR44Q5JSH3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR44Q5JSH3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms