Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A13Q5J8X5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A13Q5J8X5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms