Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
XKR4Q5GH76 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XKR4Q5GH76 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XKR4Q5GH76 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms