Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD39Q53RE8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ANKRD39Q53RE8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms