Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLHL22Q53GT1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL22Q53GT1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms