Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HSD17B12Q53GQ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HSD17B12Q53GQ0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms