Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC38Q502W7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC38Q502W7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC38Q502W7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms