Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPN20Q4JDL3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN20Q4JDL3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms