Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZBED5Q49AG3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZBED5Q49AG3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms