Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCQ8

TIMM50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50Q3ZCQ8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TIMM50Q3ZCQ8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TIMM50Q3ZCQ8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms