Protein–RNA interactions for Protein: Q3T906

GNPTAB, N-acetylglucosamine-1-phosphotransferase subunits alpha/beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTABQ3T906 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GNPTABQ3T906 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GNPTABQ3T906 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GNPTABQ3T906 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms