Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC25A52Q3SY17 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC25A52Q3SY17 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC25A52Q3SY17 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms