Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00303Q3SY05 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00303Q3SY05 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00303Q3SY05 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms