Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PCGF3Q3KNV8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PCGF3Q3KNV8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PCGF3Q3KNV8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms