Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIQ3

KIF4B, Chromosome-associated kinesin KIF4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4BQ2VIQ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.54■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
KIF4BQ2VIQ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KIF4BQ2VIQ3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIF4BQ2VIQ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KIF4BQ2VIQ3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIF4BQ2VIQ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIF4BQ2VIQ3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIF4BQ2VIQ3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIF4BQ2VIQ3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KIF4BQ2VIQ3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIF4BQ2VIQ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KIF4BQ2VIQ3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KIF4BQ2VIQ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIF4BQ2VIQ3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIF4BQ2VIQ3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KIF4BQ2VIQ3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIF4BQ2VIQ3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KIF4BQ2VIQ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KIF4BQ2VIQ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms