Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9L4

C15orf59, UPF0583 protein C15orf59, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf59Q2T9L4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C15orf59Q2T9L4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C15orf59Q2T9L4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C15orf59Q2T9L4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C15orf59Q2T9L4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C15orf59Q2T9L4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C15orf59Q2T9L4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C15orf59Q2T9L4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C15orf59Q2T9L4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C15orf59Q2T9L4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C15orf59Q2T9L4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C15orf59Q2T9L4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
C15orf59Q2T9L4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C15orf59Q2T9L4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C15orf59Q2T9L4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C15orf59Q2T9L4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C15orf59Q2T9L4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms