Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM71Q2Q1W2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM71Q2Q1W2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM71Q2Q1W2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms