Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFX7Q2KHR2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RFX7Q2KHR2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFX7Q2KHR2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms