Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SWI5Q1ZZU3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SWI5Q1ZZU3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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