Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UPP1Q16831 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UPP1Q16831 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UPP1Q16831 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms