Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP2B3Q16720 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ATP2B3Q16720 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2B3Q16720 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms