Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCAQ16586 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SGCAQ16586 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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