Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYPL1Q16563 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SYPL1Q16563 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYPL1Q16563 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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