Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKN1Q16512 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PKN1Q16512 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PKN1Q16512 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
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