Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIK5Q16478 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIK5Q16478 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIK5Q16478 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIK5Q16478 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIK5Q16478 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIK5Q16478 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GRIK5Q16478 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GRIK5Q16478 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIK5Q16478 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIK5Q16478 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIK5Q16478 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GRIK5Q16478 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIK5Q16478 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GRIK5Q16478 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GRIK5Q16478 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK5Q16478 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK5Q16478 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK5Q16478 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK5Q16478 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK5Q16478 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK5Q16478 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK5Q16478 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK5Q16478 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK5Q16478 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK5Q16478 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK5Q16478 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GRIK5Q16478 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GRIK5Q16478 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIK5Q16478 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIK5Q16478 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIK5Q16478 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GRIK5Q16478 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GRIK5Q16478 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIK5Q16478 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GRIK5Q16478 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIK5Q16478 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GRIK5Q16478 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIK5Q16478 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIK5Q16478 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIK5Q16478 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIK5Q16478 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GRIK5Q16478 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GRIK5Q16478 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GRIK5Q16478 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRIK5Q16478 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms