Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TAF1AQ15573 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF1AQ15573 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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